Najczęściej czytana publikacja w Protein Science autorstwa naukowców z Centrum Nowych Technologii

17 04 2025

Kategoria: Aktualności CeNT, Aktualności naukowe, Strona główna

Publikacja „AlphaFold predicts novel human proteins with knots” autorstwa Agaty P. Perlińskiej, Wandy H. Niemyskiej, Bartosza A. Grenia, Marka Bukowickiego, Szymona Nowakowskiego, Pawła Rubacha i Joanny I. Sułkowskiej z Interdyscyplinarnego Laboratorium Modelowania Układów Biologicznych, Centrum Nowych Technologii, Uniwersytetu Warszawskiego jest jedną z najchętniej czytanych publikacji w czasopiśmie Protein Science w ciągu ostatnich dwóch lat. Autorzy przeanalizowali wszystkie białka z ludzkiego proteomu (ponad 20 000) wyznaczone za pomocą AlphaFold w poszukiwaniu węzłów i znaleźli je w mniej niż 2% struktur. Korzystając z różnych metod, w tym wyszukiwania homologii, grupowania, oceny jakości i inspekcji wizualnej, określili naturę każdej z zawęźlonych struktur i sklasyfikowali ją jako zawęźloną, potencjalnie zawęźloną lub artefakt i zdeponowali je wszystkie w bazie danych dostępnej pod adresem: https://knotprot.cent.uw.edu.pl/alphafold. Ogólnie rzecz biorąc, znaleźli 51 wiarygodnych białek węzłowych (0,2% ludzkiego proteomu).