Najnowsza publikacja Laboratorium Genomiki Funkcjonalnej i Strukturalnej
18 03 2025
Kategoria: Aktualności naukowe, Research highlights, Strona główna
Laboratorium Genomiki Funkcjonalnej i Strukturalnej (kierownik: prof. Dariusz Plewczyński) ma przyjemność podzielić się swoją najnowszą publikacją w Communications Biology: “Improved cohesin HiChIP protocol and bioinformatics analysis for robust detection of chromatin loops and stripes.” (“Ulepszony protokół HiChIP dla kohezyny i analiza bioinformatyczna w celu niezawodnego wykrywania pętli i prążków chromatyny”).
Zespół przedstawia zoptymalizowany protokół eksperymentalny HiChIP w połączeniu z protokołm obliczeniowym opartym na Nextflow, umożliwiającym wykrywanie pętli i prążków chromatyny w wysokiej rozdzielczości, wraz z modelowaniem 3D chromosomów. Metoda ta znacznie zwiększa dokładność i powtarzalność badań interakcji chromatyny, oferując cenny wgląd w trójwymiarową organizację genomu i regulację genów.
Laboratorium Genomiki Funkcjonalnej i Strukturalnej w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego.